Zum einen ist es tatsächlich hygienischer, zum anderen dürfte es für die Mäuse auch angenehmer sein. Ein verwesender Kadaver lockt durch seinen Geruch Aasfresser an - und das sind üblicherweise Raubtiere, die auch einer Maus nicht abgeneigt sind. Genau das ist ja der Grund, weshalb Mäuse sich vor ihrem Tod (wenn möglich) vom Rudel absondern und nach ihrem Tod, wenn sie immer noch im Revier liegen, von den Rudelkameraden zugescharrt werden: damit der Geruch nicht so intensiv frei wird und keine Raubtiere anlockt. Wenn nun die Einstreu schon nach Kadaver "duftet", ist das für die Mäuse wie ein Leuchtfeuer auf feindlichem Terrain: es bedeutet ein hohes Risiko, entdeckt und selbst erbeutet zu werden. Das wiederum bedeutet einen ganz erheblichen Stress.
Also - besser wechseln.